Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL8

PHF11, PHD finger protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF11Q9UIL8 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF11Q9UIL8 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF11Q9UIL8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF11Q9UIL8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF11Q9UIL8 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF11Q9UIL8 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PHF11Q9UIL8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHF11Q9UIL8 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
PHF11Q9UIL8 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
PHF11Q9UIL8 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PHF11Q9UIL8 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms