Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFF9

CNOT8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT8Q9UFF9 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CNOT8Q9UFF9 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CNOT8Q9UFF9 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CNOT8Q9UFF9 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms