Protein–RNA interactions for Protein: Q9UEU0

VTI1B, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, humanhuman

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1BQ9UEU0 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VTI1BQ9UEU0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
VTI1BQ9UEU0 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 350.1 ms