Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP9

GULP1, PTB domain-containing engulfment adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GULP1Q9UBP9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GULP1Q9UBP9 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GULP1Q9UBP9 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
GULP1Q9UBP9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GULP1Q9UBP9 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GULP1Q9UBP9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GULP1Q9UBP9 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GULP1Q9UBP9 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms