Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBI1

COMMD3, COMM domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 195 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD3Q9UBI1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
COMMD3Q9UBI1 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
COMMD3Q9UBI1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
COMMD3Q9UBI1 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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