Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2I0

CPSF2, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF2Q9P2I0 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CPSF2Q9P2I0 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CPSF2Q9P2I0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CPSF2Q9P2I0 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms