Protein–RNA interactions for Protein: Q9P035

HACD3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HACD3Q9P035 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HACD3Q9P035 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
HACD3Q9P035 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HACD3Q9P035 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HACD3Q9P035 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms