Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZZ3

CHMP5, Charged multivesicular body protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP5Q9NZZ3 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CHMP5Q9NZZ3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CHMP5Q9NZZ3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms