Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZQ3

NCKIPSD, NCK-interacting protein with SH3 domain, humanhuman

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCKIPSDQ9NZQ3 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NCKIPSDQ9NZQ3 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NCKIPSDQ9NZQ3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms