Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN3

EHD3, EH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD3Q9NZN3 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
EHD3Q9NZN3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
EHD3Q9NZN3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.4 ms