Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI7

UBP1, Upstream-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1Q9NZI7 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
UBP1Q9NZI7 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
UBP1Q9NZI7 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
UBP1Q9NZI7 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms