Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYS0

NKIRAS1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS1Q9NYS0 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
NKIRAS1Q9NYS0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
NKIRAS1Q9NYS0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms