Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
DLL3Q9NYJ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DLL3Q9NYJ7 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms