Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG2

THUMPD1, THUMP domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD1Q9NXG2 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
THUMPD1Q9NXG2 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
THUMPD1Q9NXG2 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
THUMPD1Q9NXG2 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.7 ms