Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVH1

DNAJC11, DnaJ homolog subfamily C member 11, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC11Q9NVH1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
DNAJC11Q9NVH1 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNAJC11Q9NVH1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms