Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TMEM30AQ9NV96 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TMEM30AQ9NV96 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms