Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTX5

ECHDC1, Ethylmalonyl-CoA decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC1Q9NTX5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ECHDC1Q9NTX5 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ECHDC1Q9NTX5 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms