Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
DEPPQ9NTK1 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
DEPPQ9NTK1 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms