Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
RAB6BQ9NRW1 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
RAB6BQ9NRW1 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RAB6BQ9NRW1 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms