Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD8

DUOX2, Dual oxidase 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX2Q9NRD8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
DUOX2Q9NRD8 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.2■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC34.19■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
DUOX2Q9NRD8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
DUOX2Q9NRD8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms