Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR16

CD163L1, Scavenger receptor cysteine-rich type 1 protein M160, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD163L1Q9NR16 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC31.48■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.48■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC31.47■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC31.46■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
CD163L1Q9NR16 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC31.43■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
CD163L1Q9NR16 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
CD163L1Q9NR16 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC31.34■■■□□ 2.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms