Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MED4Q9NPJ6 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MED4Q9NPJ6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MED4Q9NPJ6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms