Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP78

ABCB9, ATP-binding cassette sub-family B member 9, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB9Q9NP78 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ABCB9Q9NP78 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ABCB9Q9NP78 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ABCB9Q9NP78 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms