Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP50

FAM60A, Protein FAM60A, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM60AQ9NP50 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM60AQ9NP50 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM60AQ9NP50 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM60AQ9NP50 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM60AQ9NP50 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM60AQ9NP50 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM60AQ9NP50 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM60AQ9NP50 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM60AQ9NP50 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM60AQ9NP50 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM60AQ9NP50 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms