Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SRA1Q9HD15 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SRA1Q9HD15 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms