Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAW4

CLSPN, Claspin, humanhuman

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSPNQ9HAW4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
CLSPNQ9HAW4 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.5■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC33.49■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
CLSPNQ9HAW4 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
CLSPNQ9HAW4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms