Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAU5

UPF2, Regulator of nonsense transcripts 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPF2Q9HAU5 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
UPF2Q9HAU5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
UPF2Q9HAU5 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
UPF2Q9HAU5 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms