Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Q4

NHEJ1, Non-homologous end-joining factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHEJ1Q9H9Q4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NHEJ1Q9H9Q4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NHEJ1Q9H9Q4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms