Protein–RNA interactions for Protein: Q9H8K7

C10orf88, Uncharacterized protein C10orf88, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf88Q9H8K7 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C10orf88Q9H8K7 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C10orf88Q9H8K7 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C10orf88Q9H8K7 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms