Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7C4

SYNC, Syncoilin, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNCQ9H7C4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SYNCQ9H7C4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SYNCQ9H7C4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms