Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6F5

CCDC86, Coiled-coil domain-containing protein 86, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC86Q9H6F5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC86Q9H6F5 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCDC86Q9H6F5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC86Q9H6F5 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC86Q9H6F5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC86Q9H6F5 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC86Q9H6F5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC86Q9H6F5 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC86Q9H6F5 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms