Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4I3

TRABD, TraB domain-containing protein, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRABDQ9H4I3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRABDQ9H4I3 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TRABDQ9H4I3 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TRABDQ9H4I3 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms