Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4E5

RHOJ, Rho-related GTP-binding protein RhoJ, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOJQ9H4E5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RHOJQ9H4E5 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RHOJQ9H4E5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RHOJQ9H4E5 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms