Protein–RNA interactions for Protein: Q9H444

CHMP4B, Charged multivesicular body protein 4b, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4BQ9H444 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CHMP4BQ9H444 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CHMP4BQ9H444 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CHMP4BQ9H444 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms