Protein–RNA interactions for Protein: Q9H329

EPB41L4B, Band 4.1-like protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L4BQ9H329 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
EPB41L4BQ9H329 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EPB41L4BQ9H329 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EPB41L4BQ9H329 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms