Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PDCL3Q9H2J4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDCL3Q9H2J4 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms