Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 900 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CCSER1Q9C0I3 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CCSER1Q9C0I3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CCSER1Q9C0I3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms