Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B9

ZCCHC2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC2Q9C0B9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZCCHC2Q9C0B9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZCCHC2Q9C0B9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms