Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0B1

FTO, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FTOQ9C0B1 FAM192A-209ENST00000565458 1029 ntTSL 524.61■■□□□ 1.536e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SDF4-206ENST00000478938 2591 ntTSL 224.59■■□□□ 1.536e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-230ENST00000590586 572 ntTSL 423.24■■□□□ 1.316e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-216ENST00000586812 466 ntTSL 223.24■■□□□ 1.316e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-229ENST00000590576 583 ntTSL 323.24■■□□□ 1.316e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 CDC37-207ENST00000589755 793 ntTSL 223.05■■□□□ 1.286e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-223ENST00000589140 552 ntTSL 422.6■■□□□ 1.216e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-243ENST00000592407 509 ntTSL 221.82■■□□□ 1.086e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-222ENST00000589070 582 ntTSL 321.27■■□□□ 16e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 MVD-214ENST00000567064 758 ntTSL 321.07■□□□□ 0.962e-6■■■□□ 15
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FTOQ9C0B1 FAM192A-215ENST00000566584 676 ntTSL 520.53■□□□□ 0.886e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-241ENST00000591934 553 ntTSL 419.99■□□□□ 0.796e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 MVD-217ENST00000569177 870 ntTSL 519.2■□□□□ 0.662e-6■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 CDR2-207ENST00000569045 826 ntTSL 519.19■□□□□ 0.666e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 BTF3-206ENST00000510787 610 ntTSL 219.09■□□□□ 0.656e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 MVD-215ENST00000568133 853 ntTSL 318.59■□□□□ 0.572e-6■■■□□ 15
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FTOQ9C0B1 SEPT9-231ENST00000590595 569 ntTSL 318.39■□□□□ 0.536e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-15■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SDF4-207ENST00000494748 3516 ntTSL 218.08■□□□□ 0.486e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 CDR2-206ENST00000567406 567 ntTSL 417.77■□□□□ 0.446e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.436e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-217ENST00000587237 548 ntTSL 516.59■□□□□ 0.256e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 CDR2-204ENST00000564542 1056 ntTSL 516.51■□□□□ 0.236e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-240ENST00000591833 576 ntTSL 416.49■□□□□ 0.236e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-232ENST00000590825 554 ntTSL 416.06■□□□□ 0.166e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.036e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 414.98□□□□□ -0.016e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.116e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 ABCF1-204ENST00000468958 606 ntTSL 314.27□□□□□ -0.136e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 FAM192A-205ENST00000562406 519 ntTSL 312.86□□□□□ -0.356e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 ABCF1-202ENST00000376545 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.416e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 FAM192A-220ENST00000569266 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.436e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 ABCF1-201ENST00000326195 3481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.536e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SRCAP-205ENST00000483083 5937 ntTSL 211.55□□□□□ -0.566e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 SRCAP-202ENST00000395059 9126 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.566e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 FAM192A-202ENST00000389447 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.586e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 ABCF1-203ENST00000441867 1074 ntTSL 511.01□□□□□ -0.656e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 FAM192A-203ENST00000562324 597 ntTSL 210.39□□□□□ -0.756e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 FAM192A-206ENST00000564108 1055 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.02□□□□□ -0.816e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 BTF3-201ENST00000335895 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.816e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 AC106886.5-201ENST00000380361 11692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.55□□□□□ -1.046e-7■■■□□ 15
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FTOQ9C0B1 SRCAP-201ENST00000262518 11754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.086e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 FAM192A-211ENST00000565956 618 ntTSL 36.88□□□□□ -1.316e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 ABCF1-207ENST00000542772 223 ntTSL 36.63□□□□□ -1.356e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 BTF3-209ENST00000514505 740 ntTSL 56.54□□□□□ -1.366e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 BTF3-208ENST00000514360 1177 ntTSL 26.53□□□□□ -1.366e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 BTF3-203ENST00000507081 377 ntTSL 56.03□□□□□ -1.446e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 BTF3-204ENST00000508901 954 ntTSL 25.8□□□□□ -1.486e-7■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 CDR2-203ENST00000563573 556 ntTSL 45.16□□□□□ -1.586e-7■■■□□ 15
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FTOQ9C0B1 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.772e-6■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 HNRNPUL1-219ENST00000601336 754 ntTSL 221.78■■□□□ 1.082e-6■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.982e-6■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.492e-6■■■□□ 15
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FTOQ9C0B1 HNRNPUL1-208ENST00000595196 3043 ntTSL 1 (best)17.39■□□□□ 0.372e-6■■■□□ 15
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FTOQ9C0B1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.66e-8■■■□□ 15
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FTOQ9C0B1 HNRNPA3-203ENST00000432457 643 ntTSL 311.09□□□□□ -0.636e-8■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.01□□□□□ -0.656e-8■■■□□ 15
FTOQ9C0B1 COL27A1-208ENST00000494780 514 ntTSL 427.02■■□□□ 1.923e-6■■■□□ 14.9
FTOQ9C0B1 DAZAP1-207ENST00000589484 3414 ntTSL 214.78□□□□□ -0.043e-8■■■□□ 14.9
FTOQ9C0B1 DAZAP1-206ENST00000587833 560 ntTSL 511.6□□□□□ -0.553e-8■■■□□ 14.9
FTOQ9C0B1 PRPF6-201ENST00000266079 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.123e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.366e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.271e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.761e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.41e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.381e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.261e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.171e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.061e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-214ENST00000592483 431 ntTSL 526.98■■□□□ 1.911e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.791e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.751e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 CAPNS1-212ENST00000591041 812 ntTSL 325.83■■□□□ 1.731e-7■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.051e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-206ENST00000538646 1649 ntTSL 1 (best)25.3■■□□□ 1.641e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-208ENST00000595881 2681 ntTSL 223.18■■□□□ 1.31e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-209ENST00000541924 1594 ntTSL 1 (best)22.54■■□□□ 1.21e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 PLCB1-224ENST00000636319 2930 ntTSL 522.13■■□□□ 1.131e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.031e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.021e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.931e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.921e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 FCGRT-214ENST00000598927 1616 ntTSL 520.66■□□□□ 0.91e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.81e-6■■■□□ 14.8
FTOQ9C0B1 HNF1A-213ENST00000544574 725 ntTSL 1 (best)19.85■□□□□ 0.771e-6■■■□□ 14.8
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