Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0A0

CNTNAP4, Contactin-associated protein-like 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP4Q9C0A0 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
CNTNAP4Q9C0A0 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.2■■■□□ 2.27
CNTNAP4Q9C0A0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CNTNAP4Q9C0A0 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 138.8 ms