Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE4

GTPBP4, Nucleolar GTP-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTPBP4Q9BZE4 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GTPBP4Q9BZE4 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
GTPBP4Q9BZE4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GTPBP4Q9BZE4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms