Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRIM55Q9BYV6 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRIM55Q9BYV6 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms