Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
C1QTNF3Q9BXJ4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
C1QTNF3Q9BXJ4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms