Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOL6Q9BWW8 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOL6Q9BWW8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOL6Q9BWW8 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
APOL6Q9BWW8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APOL6Q9BWW8 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APOL6Q9BWW8 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOL6Q9BWW8 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APOL6Q9BWW8 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOL6Q9BWW8 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APOL6Q9BWW8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.9 ms