Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVS4

RIOK2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIOK2Q9BVS4 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RIOK2Q9BVS4 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RIOK2Q9BVS4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RIOK2Q9BVS4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms