Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL4

SELENOO, Selenoprotein O, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELENOOQ9BVL4 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SELENOOQ9BVL4 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SELENOOQ9BVL4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SELENOOQ9BVL4 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SELENOOQ9BVL4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SELENOOQ9BVL4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SELENOOQ9BVL4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SELENOOQ9BVL4 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SELENOOQ9BVL4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELENOOQ9BVL4 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELENOOQ9BVL4 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELENOOQ9BVL4 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms