Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV19

C1orf50, Uncharacterized protein C1orf50, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf50Q9BV19 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
C1orf50Q9BV19 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C1orf50Q9BV19 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms