Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUK0

CHCHD7, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD7Q9BUK0 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CHCHD7Q9BUK0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CHCHD7Q9BUK0 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms