Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
NDUFAF3Q9BU61 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
NDUFAF3Q9BU61 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms