Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CHRDL1Q9BU40 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
CHRDL1Q9BU40 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms